陈士铎有独立完整的思想体系
理论有《外经微言》，
本草有《本草新编》，
脉决有《脉诀阐微》，
治法有《石室秘录》，
辨证有《辨证玉函》，
医案有《辩证录》《洞天奥旨》。
陈士铎先生的“怪”在于他明确了人体生命主次 ：
以“命门”“脾肾”为主，也就是人体生命的重心必须饱满（“肾水”充盈），其中的活力（相火）才会有序激发全身内外联动以低能耗来实现高效率运转（正气存内，邪气不可干）。远公很重视命门真火和真水衰弱，书中提的最多就是命门火衰和命门真水不足，找到病症根源，这个比多少医家哪里虚治哪里高明不少。
内经早就说人全身所有东西都内连五脏，远公提出不必管是腑是脏，腑病治脏，脏安而腑自安，所以远公描写到最后全是五脏，这极大缩减了范围和用药，而且通过五脏相生相克和子母关系，很多复杂的问题就简单了，大道至简！
远公的书会把症状，病因，治法，药方解释的明明白白，很多是别的医家没写的，不再是那么玄幻，让人看了直呼过瘾！
1、理论有《外经微言》
一篇救母篇，就讲清了女人例假问题原因。
一篇诊原篇，提出独取寸口、三部九候、人迎脉口外第四种诊法，这得是多厉害的事情，可惜没流传开。
一篇五行生克篇，补充了五行直接生克外，还存在生中有克，克中有生。其中精华之一，五行相生相克理论的一大进步。其他医家只提脾土衰不能生肺金，他提出脾火太旺，生的肺金也是热的，脾土太寒，生的肺金也是寒的，所以很多热咳寒咳的根源在脾胃寒。这一点让我想通了很多问题，试的效果也很好。
十八篇五脏七腑任督二脉阴阳二跷奇恒之腑的功能都说明了一下。
一篇命门经主篇，强调命门对人的重要性。
一篇昼夜轻重篇，告诉大家有些病固定时间发病的原因。
81篇每一篇都有阐发，实讲前人未讲或未细讲之事，是陈士铎的思想特点。把复杂问题短篇说清楚，正所谓大道至简是远公的一大特点。
2、脉决有《脉诀阐微》（而且还在《外经微言》里提出诊原法，这个是他首创了吧，不过没传播开，可惜）
《脉诀阐微》分三篇，第一篇每种脉代表啥，第二篇讲兼脉又代表啥，第三篇具体寸关尺脉象对应的病症。而且强调不必管脉象是腑是脏，腑病治脏，脏安而腑自安。这不就是很多人梦寐以求的把脉就能知道病人原因的东西吗？
3、《本草新编》除了重复了本草中的性味归经，（就是这个药是治肾，治脾，治肝还是哪的。）升降浮沉外，（告诉你这个药是往那边走的。）每一味药都加上自己的了解（很多是别的书没有的），用药方举例这味药的效果，要多用还是少用，有些是多用和少用效果不一样（比如人参少用往上走补心肺，多用往下走补肝肾），搭配什么药效果最好。
阐明七方论，说明了配药君臣佐使原则，
十剂论来归纳药方类型。强调药简力专。非常推荐看看！有宣剂、有通剂、补剂、泻剂、轻剂、重剂、滑剂、涩剂、燥剂、湿剂。
4、治法有《石室秘录》
病讲完了，该讲治法了，于是《石室秘录》出场了。每一种病都讲了该如何治，然后提出典型药方。
5、辨证有《辨证玉函》
《辨证玉函》讲了陈士铎的八纲辨证，阴阳虚实上下真假，给出很明显的辩证症状，非常有价值，然而非常不被人重视。
新的阴阳虚实上下真假的八纲辨证。
6、医案有《辩证录》《洞天奥旨》。
很多人看《辨证录》，总感觉感觉几种里难以分辨，就是因为没有把远公《脉决阐微》《辨证玉函》里的脉和症带入去分析。
后面《辨证奇闻》《辨证录》《洞天奥旨》数百个病例，先讲病症，怎么产生的，怎么治，用什么药方，这个药方是怎么治病的。
《洞天奥旨》讲皮肤病的，主张皮肤出问题是内在脏腑经络的问题体现，治好内在皮肤病就能好。里面有提到痔疮、湿疹、座疮这些治法，也不知道灵不灵。
远公治外科又是一绝，远公认为外科疾病得以经络为核心，你身上哪里有问题，得先考虑在哪条经络，然后诊断邪在经在脏，然后治内脏经络，不然就跟涂止痒剂一样。
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